色谱分析法是应用广泛的一种物理化学分析，气相色谱法在食品安全检测领域的应用极其普遍，主要有以下几个方面：蔬菜和水果中的有机氯、鱼类产品中的有机磷农药残留和兽药残留受到社会的广泛关注。目前，GC/ECD气相色谱用于检测有机氯农药残留，GC/NPD气相色谱检测有机磷和有机氮农药残留，GC/FPD气相色谱检测有机磷和有机硫农药残留等分析技术已经非常成熟。
多环芳烃、添加剂和丙烯酰胺的测定与分析
多环芳烃(PAHs)是一类重要的环境和食品污染物，其中许多具有致突变性和致癌性。食品中PAHs污染主要存在于烟熏和烧烤食品中。GC/MS技术可快速检测和分析20多种常见的多环芳烃；GC/FID气相色谱法可用于食品防腐剂山梨酸和苯甲酸的含量测定。用GC/ECD气相色谱法测定油炸食品中丙烯酰胺的含量，用GC/FID气相色谱法测定面粉中过氧化苯甲酰的含量。
发酵饮料产品中风味组分的分析
白酒是我国的传统饮料酒，工艺精良，风味独特，而其香味组成极其复杂。甲醇是白酒中的主要有害成分。为了准确地测定白酒中的酒精含量，检测白酒中是否掺假，气相色谱法已成为白酒工业中不可缺少的检测手段。采用GC/FID气相色谱法测定白酒中甲醇和杂醇油的含量。
啤酒、葡萄酒和饮料中含有大量的挥发性物质和风味物质。采用顶空气相色谱法(HS-GC)测定啤酒中的硫化物、有害色素和挥发性气体等有害成分。
食品包装袋有害物质的检测
食品包装袋中加入了大量的增塑剂，其中邻苯二甲酸酯类(邻苯二甲酸酯，PAEs)是应用最广泛的增塑剂。邻苯二甲酸酯类化合物在接触食品中的油脂时会溶解，特别是在加热条件下，对动物和人体具有慢性毒性，并具有致突变和致癌作用。采用GC/FID气相色谱法可同时测定塑料食品袋和包装食品中的5种邻苯二甲酸酯类化合物。对邻苯二甲酸二甲酯(DMP)、邻苯二甲酸二乙酯(DEP)、邻苯二甲酸二丁酯(DBP)、邻苯二甲酸二辛酯(DOP)和邻苯二甲
酸二异辛酯(DE-HP)进行了准确的分离和检测。
气相色谱法的食用植物油中残留溶剂及脂肪酸组成分析国家标准规定以6号溶剂油配制标准溶液，用顶空气相色谱法(HS-GC)测定食用植物油中的残留溶剂。该方法能有效地分离和检测C6~C8烷烃和芳香烃。GC/FID法还可检测食用植物油中30多种脂肪酸，主要用于芥酸含量的检测和分析，因为芥酸可能对人体营养状况产生不良影响，引起甲状腺肥大等副作用。
